A instância Clob está vinculada ao 'oracleConnection' que você usa para criá-la e o SimpleJDBCCall usa outra conexão para a chamada de banco de dados. Existem duas sessões independentes do ponto de vista do banco de dados e essa é a razão pela qual o clob não existe na sessão usada pelo SimpleJDBCCall.
A conexão que o SimpleJDBCCall usa deve ser usada para a criação do Clob.
Consegui resolver um problema semelhante implementando SQLData e extraindo a conexão atual:
Map<String, Object> values = new HashMap<>();
values.put("IN_bean_type", new MyBean());
simpleJdbcCallOperations.execute(values);
MeuBean:
class MyBean implements SQLData {
...
@Override
public void writeSQL(SQLOutput stream) throws SQLException {
...
Clob clob = ((OracleSQLOutput)stream).getSTRUCT().getJavaSqlConnection().createClob(); //hack to get the current connection
clob.setString(1, "stringValue");
stream.writeClob(clob);
...
}
...
}