Você não pode acessar um CTE fora de toda a instrução. E você não pode acessar partes individuais de um CTE fora do SELECT final de um CTE.
Você precisa colocar o todo CTE (incluindo a instrução SELECT final) em o loop do cursor:
FOR R IN (WITH TMP1 AS (.....),
TMP2 AS (......),
TMP3 AS (......)
SELECT DISTINCT .....
FROM TMP1
JOIN temp2 ON ...
JOIN temp3 ON ...
WHERE .....)
LOOP
-- here goes the code that processes each row of the query
END LOOP;
