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Comparar linhas e colunas da mesma tabela


Que tal usar um join ? O seguinte mostra todos os pares que são diferentes:
select tb.*, ts.*
from company tb join
     company ts
     on tb.company_name = ts.company_name and
        ts.address_type = 'shipping' and
        tb.address_type = 'billing' and
        ts.address <> tb.address;

Se você quer apenas as empresas que são diferentes:
select company_name
from company t
group by company_name
having count(distinct case when t.address_type = 'billing' then address end) = 1 and
       count(distinct case when t.address_type = 'shipping' then address end) = 1 and
       (max(case when t.address_type = 'billing' then address end) <>
        max(case when t.address_type = 'shipping' then address end)
       );

Observação:isso também verifica se há apenas um endereço de cobrança e envio distinto.