A maioria das estruturas de registro tem a noção de Contexto de diagnóstico aninhado . Você pode salvar sua consulta e seus parâmetros lá quando preencher a instrução preparada.
Ou, talvez, faça isso em uma etapa:
PreparedStatement fillAndLog(Connection conn, String query, Object... args) {
int i = 0;
PreparedStatement pstmt = conn.prepareStatement(query);
for (Object o : args) {
if (o instanceof String) {
pstmt.setString(i, (String)o);
} // else...
i++;
}
log.debug(String.format(query.replaceAll("\\?", "%s"), args));
return pstmt;
}