Por algum motivo, para mim só funcionou:
spring.datasource.url=jdbc:oracle:thin:@(DESCRIPTION=(ADDRESS_LIST=(ADDRESS=(PROTOCOL=tcp)(HOST=TODO)(PORT=1521)))(CONNECT_DATA=(SERVICE_NAME=TODO)))
em vez de
spring.datasource.url=jdbc:oracle:thin:@MY_SERVICE.
Também estou chamando o método determineAndSetTnsHome() sugerido pelo usuário M. Deinum na resposta aceita:
public static void main(String[] args) {
SpringApplication.run(EvaApplication.class, args);
determineAndSetTnsHome();
}