Mesmo que você não tenha a chave primária, cada registro possui um rowid exclusivo associado.
Ao usar a consulta abaixo, você exclui apenas os registros que não possuem o id de linha máximo, unindo-se automaticamente a uma tabela com as colunas que causam duplicação. Isso garantirá que você exclua quaisquer duplicatas.
DELETE FROM PPLP_LOAD_GENSTAT plg_outer
WHERE ROWID NOT IN(
select MAX(ROWID)
from PPLP_LOAD_GENSTAT plg_inner
WHERE plg_outer.pplp_name = plg_inner.pplg_name
AND plg_outer.start_time= plg_inner.start_time
AND plg_outer.end_time = plg_inner.end_time
);