Toda linha extra de código diminui o desempenho do código. Afinal, é uma instrução extra a ser executada, que pelo menos consome alguma CPU. Então sim, dbms_output.put_line diminui o desempenho.

A verdadeira questão é:o benefício dessa linha extra de código supera a perda de desempenho? Só você pode responder a essa pergunta.

Atenciosamente,
Rob.