Se você DROP e CREATE o procedimento, você perderá as configurações de segurança. Isso pode incomodar seu DBA ou interromper completamente seu aplicativo.
O que eu faço é criar um procedimento armazenado trivial se ele ainda não existir. Depois disso, você pode ALTERAR o procedimento armazenado ao seu gosto.
IF object_id('YourSp') IS NULL
EXEC ('create procedure dbo.YourSp as select 1')
GO
ALTER PROCEDURE dbo.YourSp
AS
...
Dessa forma, as configurações de segurança, comentários e outros metadados sobreviverão à implantação.
