Há uma variedade de coisas que podem estar erradas.
- você pode estar conectado a uma instância do SQL Server 2005 ou anterior, ou SQL Azure
- seu script pode ser muito grande (Ferramentas / Opções / Editor de Texto / Transact-SQL/ IntelliSense / Tamanho Máximo do Script)
- você pode estar no modo SQLCMD
- certifique-se de que o Management Studio esteja corrigido para>=@@VERSION do servidor - os service packs também são importantes para as ferramentas do cliente
- suplementos de terceiros podem estar interferindo
- o problema do VS que @Shark apontou
Minha sugestão? Comece a jogar com o SQL Server 2012 SSMS. Claro, é apenas um candidato a lançamento neste momento, mas eu o tenho usado como minha principal ferramenta de gerenciamento por mais de um ano e é tão ou mais estável do que as ferramentas 2008/2008 R2. E o IntelliSense também tem algumas boas melhorias.