Você deseja aproveitar o inserido tabela lógica que está disponível no contexto de um gatilho. Ele corresponde ao esquema da tabela que está sendo inserida e inclui a(s) linha(s) que será(ão) inserida(s) (em um gatilho de atualização você tem acesso ao inserido e excluído tabelas lógicas que representam os dados novos e originais, respectivamente.)
Portanto, para inserir pares Funcionário/Departamento que não existem atualmente, você pode tentar algo como o seguinte.
CREATE TRIGGER trig_Update_Employee
ON [EmployeeResult]
FOR INSERT
AS
Begin
Insert into Employee (Name, Department)
Select Distinct i.Name, i.Department
from Inserted i
Left Join Employee e
on i.Name = e.Name and i.Department = e.Department
where e.Name is null
End
