Esse problema existe há anos no SQL Server. Geralmente, leva algum tempo para iniciar e parar o depurador antes de sincronizar com a versão correta da fonte.
Você também notará que algumas janelas estão abertas mostrando a última fonte que o depurador conhece. Eles precisam ser fechados. Mesmo que seja um pita, a maneira mais rápida de resolver o problema é parar o estúdio de gerenciamento e reiniciá-lo.