Eu nunca uso NATURAL JOIN porque não gosto da possibilidade de que a junção possa fazer algo que não pretendo apenas porque existe algum nome de coluna em ambas as tabelas.

Eu uso o USING sintaxe de junção ocasionalmente, mas com a mesma frequência eu preciso de uma condição de junção mais complexa do que USING pode suportar, então eu converto para o equivalente ON sintaxe afinal.