Você tem duas maneiras para sua pergunta:
1- Use o comando Update no seu Trigger.
ALTER TRIGGER [dbo].[tr_SCHEDULE_Modified]
ON [dbo].[SCHEDULE]
AFTER UPDATE
AS BEGIN
SET NOCOUNT ON;
IF UPDATE (QtyToRepair)
BEGIN
UPDATE SCHEDULE
SET modified = GETDATE()
, ModifiedUser = SUSER_NAME()
, ModifiedHost = HOST_NAME()
FROM SCHEDULE S INNER JOIN Inserted I
ON S.OrderNo = I.OrderNo and S.PartNumber = I.PartNumber
WHERE S.QtyToRepair <> I.QtyToRepair
END
END
2- Use Join entre a tabela inserida e a tabela excluída
ALTER TRIGGER [dbo].[tr_SCHEDULE_Modified]
ON [dbo].[SCHEDULE]
AFTER UPDATE
AS BEGIN
SET NOCOUNT ON;
UPDATE SCHEDULE
SET modified = GETDATE()
, ModifiedUser = SUSER_NAME()
, ModifiedHost = HOST_NAME()
FROM SCHEDULE S
INNER JOIN Inserted I ON S.OrderNo = I.OrderNo and S.PartNumber = I.PartNumber
INNER JOIN Deleted D ON S.OrderNo = D.OrderNo and S.PartNumber = D.PartNumber
WHERE S.QtyToRepair <> I.QtyToRepair
AND D.QtyToRepair <> I.QtyToRepair
END
Quando você usa o comando de atualização para a tabela
SCHEDULE e defina QtyToRepair Coluna para o novo valor, se o novo valor for igual ao valor antigo em uma ou várias linhas, a solução 1 atualizará todas as linhas atualizadas na tabela de agendamento, mas a solução 2 atualizará apenas as linhas de agendamento cujo valor antigo não é igual ao novo valor. 
