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MySQL/PDO trunca os dados


Há dois pontos a serem feitos aqui. Uma é que, idealmente, todas as codificações de caracteres devem ser UTF8 - isso é servidor, cliente, conexão e tabela. Dois é que o strlen do PHP função conta bytes, não caracteres.

Seu conjunto de caracteres de tabela pode não estar definido como UTF8 . Você pode fazer
SHOW CREATE TABLE chemicals;

para verificar isso. Você também deve adicioná-los ao seu my.cnf :
[mysqld]
character-set-client=utf8
character-set-results=utf8

Leia mais sobre conjuntos de caracteres MySQL aqui:

Conjuntos de caracteres MySQL