O que eu uso é um design diferente, e embora tenha limitações, se você aguentar, é muito simples e muito eficiente.
Aqui está um exemplo de árvore taxonômica de pássaros, então a hierarquia é Classe/Ordem/Família/Gênero/Espécie - espécie é o nível mais baixo, 1 linha =1 espécie:
CREATE TABLE `taxons` (
`TaxonId` smallint(6) NOT NULL default '0',
`ClassId` smallint(6) default NULL,
`OrderId` smallint(6) default NULL,
`FamilyId` smallint(6) default NULL,
`GenusId` smallint(6) default NULL,
`Name` varchar(150) NOT NULL default ''
);
e o exemplo dos dados:
+---------+---------+---------+----------+---------+-------------------------------+
| TaxonId | ClassId | OrderId | FamilyId | GenusId | Name |
+---------+---------+---------+----------+---------+-------------------------------+
| 254 | 0 | 0 | 0 | 0 | Aves |
| 255 | 254 | 0 | 0 | 0 | Gaviiformes |
| 256 | 254 | 255 | 0 | 0 | Gaviidae |
| 257 | 254 | 255 | 256 | 0 | Gavia |
| 258 | 254 | 255 | 256 | 257 | Gavia stellata |
| 259 | 254 | 255 | 256 | 257 | Gavia arctica |
| 260 | 254 | 255 | 256 | 257 | Gavia immer |
| 261 | 254 | 255 | 256 | 257 | Gavia adamsii |
| 262 | 254 | 0 | 0 | 0 | Podicipediformes |
| 263 | 254 | 262 | 0 | 0 | Podicipedidae |
| 264 | 254 | 262 | 263 | 0 | Tachybaptus |
Isso é ótimo porque assim você realiza todas as operações necessárias de uma forma muito fácil, desde que as categorias não mudem de nível na árvore.