Tente usar
var_dump() em vez de echo . Valores booleanos não funcionam bem com echo . var_dump( $this->db->table_exists('users') );
O código-fonte de
table_exists se parece com isso:function table_exists($table_name)
{
return ( ! in_array($this->_protect_identifiers($table_name, TRUE, FALSE, FALSE), $this->list_tables())) ? FALSE : TRUE;
}
Atualizar dos comentários
Se você der uma olhada em _protect_identifiers ele adiciona o nome do banco de dados ao nome da tabela. Mas deve haver um . entre
db.table . Talvez sua configuração de banco de dados esteja confusa? 
