Você pode definir seu delimeterType como "row" no bloco de configuração.
<configuration>
...
<delimiterType>row</delimiterType>
...
</configuration>
tipo de delimitador
Veja mais em http://mojo.codehaus.org/ sql-maven-plugin/execute-mojo.html#delimiterType
Por exemplo:create-proc.sql
CREATE PROCEDURE ADD_BOOK (IN title VARCHAR(100))
BEGIN
-- your sql code
INSERT INTO Book (title) VALUES (title);
END
; -- this means the end of the sql command
