Como @Fabrice- SonarQube Team sugeriu que você está executando o SonarQube Server em cima do Mysql. Se você quiser verificar, pode verificar no arquivo Sonar.properties.
para remover esses problemas, você deve modificar o my.cnf(Linux) ou my.ini(para windows).
[mysqld]
max_allowed_packet=256M
se você quiser definir o mesmo Globally.Log no Mysql e execute o seguinte comando.
SET GLOBAL max_allowed_packet=1073741824;
Depois de fazer essas configurações, reinicie o Mysql Server.
