O problema é que
store com id 1 tem dois registros correspondentes em store_sub table, o que significa que qty O campo aparecerá duas vezes para a loja 1. Você precisa somar as 2 tabelas separadamente em subconsultas e juntar as versões somadas:select t1.department, t1.sqty, t2.ssubqty
from
(select department, sum(qty) as sqty from store group by department) t1
left join
(select s2.department, s1.sum(sub_qty) as ssubqty
from store_sub s1
inner join store s2 on s1.parent_id=s2.id
group by s2.department) t2 on t1.department=t2.department
