como usar um banco de dados MySql no Eclipse

Se você precisar de algum tipo de explorador de dados dentro do seu eclipse, você pode ver os links fornecidos acima ou mais especificamente a documentação do plugin.

OTOH, se você quiser saber como se conectar a um banco de dados mysql usando JDBC, o exemplo de código abaixo explica isso.

Connection connection = null;
        try {
            //Loading the JDBC driver for MySql
            Class.forName("com.mysql.jdbc.Driver");

            //Getting a connection to the database. Change the URL parameters
            connection = DriverManager.getConnection("jdbc:mysql://Server/Schema", "username", "password");

            //Creating a statement object
            Statement stmt = connection.createStatement();

            //Executing the query and getting the result set
            ResultSet rs = stmt.executeQuery("select * from item");

            //Iterating the resultset and printing the 3rd column
            while (rs.next()) {
                System.out.println(rs.getString(3));
            }
            //close the resultset, statement and connection.
            rs.close();
            stmt.close();
            connection.close();
        } catch (SQLException e) {
            e.printStackTrace();
        } catch (ClassNotFoundException e) {
            e.printStackTrace();
        }