Isso é normal por causa da junção implícita que você fez! Por que você simplesmente não solicita duas consultas, uma por tabela, e depois mescla os resultados em uma matriz?
public function getcentrelist()
{
$this->load->database();
$query_courses= $this->db->query('SELECT course_name as name from tbl_training_courses');
$query_centers= $this->db->query('SELECT centre_name as name from tbl_traning_centres');
$courses = $query_courses->result();
$centers = $query_centers->result();
return array_merge($courses,$centers);
}
Observe que renomeei os campos course_name e center name para um nome unificado:"name", isso é necessário para ter uma tabela mesclada coerente.
