Você pode usar o CRON para realizar este trabalho. Mas se você precisar limpar seu banco de dados de pedidos incompletos apenas para mostrar os concluídos para humanos e não exportá-los para outros lugares (por exemplo, o gerente visita o back-end uma vez por dia e procura os pedidos concluídos manualmente), sugiro que você não contrate CRON para isso. Você pode adicionar algumas linhas de código que removerão entradas antigas do banco de dados sempre que o backend for acessado.

As consultas DELETE são executadas muito rápido, então não haverá problemas com o desempenho. A exclusão de dados reais será realizada apenas mediante solicitação. Além disso, você não precisa ter CRON (alguns provedores de hospedagem baratos não dão acesso a este serviço).