Traduzir a junção do MySQL para a sintaxe do SQL Server?

WITH Data AS
(
 SELECT ROW_NUMBER() OVER (PARTITION BY ID ORDER BY Date DESC) AS Row_Number,
 ID,
 AverageValue
 FROM Table
)
SELECT * FROM Data WHERE Row_Number = 1

Esta é a maneira que você deve fazer isso no SQL Server. Isso torna "último/primeiro/máximo/min/maior-n-por grupo" fácil como torta.

PARTITION BY palavra-chave aqui é igual ao seu GROUP BY e a instrução ORDER BY aqui seria traduzido para o MAX função agregada que você usou no MySQL

Usar isso permitiria que você fizesse algumas coisas extravagantes como:

WITH Data AS
    (
     SELECT ROW_NUMBER() OVER (PARTITION BY ID ORDER BY Date DESC) AS Row_Number,
     ID,
     AverageValue
     FROM Table
    )

SELECT Newest.ID, 
Newest.AverageValue, 
(Newest.AverageValue - Next_Newest.AverageValue) AS AverageValue_Change,
Newest.Date
 FROM Data Newest
LEFT OUTER JOIN Data Next_Newest 
 ON Newest.Row_Number+1 = Next_Newest.Row_Number
AND Newest.ID = Next_Newest.ID 

WHERE Newest.Row_Number=1