Quando você estiver executando a partir do prompt de comando depois de compilar sua classe, use este
java -classpath .;mysql-connector-java-5.0.8-bin.jar Version
Mantenha o jar e o arquivo java no mesmo diretório e tente. usar ";" em vez de ":" como mencionado acima.inclua o nome do pacote se houver. Eu testei seu funcionamento.