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Existe uma única consulta que pode atualizar um número de sequência em vários grupos?


Você pode usar outra variável armazenando o type_id anterior (@type_id ). A consulta é ordenada por type_id , portanto, sempre que houver uma alteração em type_id , a sequência deve ser redefinida para 1 novamente. 
Set @seq = 0;
Set @type_id = -1;

Update `log`
Set `sequence` = If(@type_id=(@type_id:=`type_id`), (@seq:[email protected]+1), (@seq:=1))
Order By `type_id`, `created_at`;