fazer um loop de uma consulta mysql

Isso deve remover loops desnecessários e consultas extras, isso pode não resolver todas as suas respostas, mas pode ajudá-lo ao longo do caminho.

Eu não testei este código, então certifique-se de executá-lo primeiro em um ambiente de teste para ter certeza de que não cometi um simples erro que poderia levar a perda de dados, devido à natureza das consultas, coloquei este aviso, TESTE PRIMEIRO COM DADOS DE TESTE POR FAVOR .

    $rest_max = '200';

    $query = "SELECT * 
        FROM `mailer_lists` ml  
            JOIN `mailer_controller` mc ON ml.project_name = mc.project_name
        WHERE `email` LIKE '%".$throttle_domain."' LIMIT ".$trim_speed."" ;

    $result = mysql_query($query) or die(mysql_error());
    $delete=array();

    while($row = mysql_fetch_assoc($result)){
        $email = $row['email'];
        $project_name = $rowa['project_name'];
        $from_name = $rowa['from_name'];
        $from_email = $rowa['from_name']."@".$node_domain;
        $subject = $rowa['subject'];
        $body = $rowa['body'];
        $content = addslashes($body);

    // set header
    $header_from = 'From: '.$from_name.' <'.$from_email.'>';
    $header_reply_to = '-f  '.$from_email;

    // send mail
    mail($email,$subject,$body,$header_from,$header_reply_to);


    $delete[] = " (project_name = '$project_name' AND email = '$email') ";
}

if (!empty($delete)) {
    mysql_query("DELETE FROM mailer_lists 
        WHERE " . implode(' OR ', $delete)) or die(mysql_error());  
}

Uma maneira fácil de testar é comentar o mail parte e altere o DELETE FROM para SELECT * FROM e ecoe o que vem do select para garantir que os dados apropriados que deveriam ter sido excluídos saíram.

LEIA ABAIXO

Uma maneira melhor de fazer a exclusão, no entanto, é usar o ID Tables campo e armazená-lo no $delete . Como isso aliviaria o OR e minimizar o erro de excluir acidentalmente linhas válidas. Aqui está como isso funcionaria (apenas usei o final, substitua ID com qualquer que seja o seu campo id:

    $delete[] = $row['id'];
}

if (!empty($delete)) {
    mysql_query("DELETE FROM mailer_lists 
        WHERE id IN(" . implode(', ', $delete) . ")") or die(mysql_error());  
}

ATUALIZAÇÃO

Não tenho certeza de quão rápido isso será executado etc. Mas uma maneira possível de fazer isso, sem tê-lo dentro de um loop é:

    // Fill the array however you want to with the domains. this is just an example
    $throttle = array('domain1.com', 'domain2.com', 'domain3.com');
    $query = "SELECT * 
        FROM `mailer_lists` ml  
            JOIN `mailer_controller` mc ON ml.project_name = mc.project_name
        WHERE `email` LIKE '%". implode("' OR `email` LIKE '%", $throttle) . "'  LIMIT ".$trim_speed." ORDER BY project_name, email";

Novamente, isso não foi testado, e não tenho certeza de quão em termos de desempenho isso corresponderia. Mas algo para você testar.

EDITAR :Alterado para fetch_assoc ao contrário de fetch_array