Uma abordagem pode ser a primeira subconsulta e emparelhar cada registro com o registro que possui o maior carimbo de data/hora mais próximo. Em seguida, consulte isso e retorne todos os registros com uma lacuna de tamanho suficiente.
SELECT
DateTime AS GapStart,
NextDateTime AS GapEnd,
TIMESTAMPDIFF(SECOND, DateTime, NextDateTime) AS SizeInSecond
FROM
(
SELECT DateTime, Value,
(SELECT MIN(DateTime) FROM #time t2
WHERE t2.DateTime > t1.DateTime) AS NextDateTime
FROM #time t1
) t
WHERE
TIMESTAMPDIFF(SECOND, DateTime, NextDateTime) > 5; -- or whatever threshhold you want

Demonstração
ADICIONAR à resposta original
Se
DateTime
está sempre crescendo, a melhoria da velocidade pode ser obtida alterando o SELECT interno:SELECT
DateTime AS GapStart,
NextDateTime AS GapEnd,
TIMESTAMPDIFF(SECOND, DateTime, NextDateTime) AS SizeInSecond
FROM
(
SELECT DateTime, Value,
(SELECT DateTime FROM #time t2
WHERE t2.DateTime > t1.DateTime LIMIT 1) AS NextDateTime
FROM #time t1
) t
WHERE
TIMESTAMPDIFF(SECOND, DateTime, NextDateTime) > 5;