Do doc
Se esse não for o caso do seu sistema operacional, você poderá lidar com isso durante a atualização com truncar
UPDATE my_table
SET my_decimal_field = truncate(123.123456789, 5)
WHERE id = 1
Demonstração do SQLFiddle
UPDATE my_table
SET my_decimal_field = truncate(123.123456789, 5)
WHERE id = 1
