você deve usar
MYSQL_HOST , MYSQL_USER , MYSQL_PASSWORD e MYSQL_DB diretivas de configuração:http://flask-mysqldb.readthedocs.org/en/latest /#configuração
app.config['MYSQL_USER'] = 'root'
app.config['MYSQL_PASSWORD'] = '1234'
app.config['MYSQL_DB'] = 'EmpData'
app.config['MYSQL_HOST'] = 'localhost'
