Você pode tentar colocar os nomes dos nós pais de um elemento em outro campo da tabela como parent_name
id name parent_name ref_num
1 shiporder root 0
2 orderperson shiporder 1
3 shipto shiporder 1
4 name shipto 3
5 address shipto 3
.....
E então você pode inserir o ref_num usando a consulta fornecida no link a seguir
Coluna de atualização do MySQL de outra coluna em mesma tabela