Aqui está uma ótima maneira sem tocar em nada no sistema operacional:
Etapa 1) Exporte todos os usuários para o arquivo SQL como este:
Etapa 2) Desative todos os usuários, exceto [email protected]
DELETE FROM mysql.user WHERE CONCAT(user,host) <> 'rootlocalhost';
FLUSH PRIVILEGES;
Passo 3) Faça sua manutenção
Etapa 4) Recarregue as concessões
mysql -h localhost -u root -p rootpassword < /root/MySQLGrants.sql
Experimente isso !!!!
PS
serviço mysql restart --skip-networking
ainda seria a maneira mais simples e rápida, além de fazer logoff de todas as conexões antes da manutenção
apenas execute o serviço mysql restart após sua manutenção