Se você não pode ter um script em execução contínua, algo deve acioná-lo, então isso teria que depender dos componentes internos do seu sistema operacional. Em um ambiente unix, um cron job, como você declara, faria o truque.

Defina o cron para executar o script e faça o script aguardar um determinado tempo e, em seguida, continue executando e enviando até que o próximo e-mail seja mais do que esse tempo determinado. Em seguida, faça seu script adicionar um novo cron job para um novo horário de ativação.