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Como adicionar coluna personalizada na grade de vendas/pedidos no Magento?


Se na sua _prepareCollection método eu imprimo a consulta via:
echo $collection->getSelect()->assemble();

Eu entendi isso:
SELECT 
    `main_table`.*, 
    group_concat(sales_flat_shipment_track.track_number SEPARATOR ",") AS `track_number`, 
    group_concat(sales_flat_shipment_track.title SEPARATOR ",") AS `title` 

FROM `sales_flat_order_grid` AS `main_table` 

INNER JOIN `sales_flat_shipment_track` 
    ON main_table.entity_id = sales_flat_shipment_track.order_id

Por essa consulta sempre obterei um resultado, mesmo uma linha "vazia" quando não houver pedidos na tabela. Em vez disso, acho que o que você está tentando alcançar pode ser feito usando subconsultas:
SELECT 
    `main_table`.*, 
    (
        SELECT 
            group_concat(`t`.`track_number` SEPARATOR ",") AS `track_number`

        FROM `sales_flat_shipment_track` AS `t`

        WHERE `main_table`.`entity_id` = `t`.`order_id`
    ),
    (
        SELECT 
            group_concat(`t`.`title` SEPARATOR ",") AS `title`

        FROM `sales_flat_shipment_track` as `t`

        WHERE `main_table`.`entity_id` = `t`.`order_id`
    )

FROM `sales_flat_order_grid` AS `main_table`;

Então, para traduzir isso para o Magento, seria algo assim:
protected function _prepareCollection()
{
    $collection = Mage::getResourceModel('sales/order_grid_collection');

    $collection->getSelect()
        ->from(
            array(),
            array(
                'track_number' => new Zend_Db_Expr('(
                    SELECT GROUP_CONCAT(`t`.`track_number` SEPARATOR ",")
                    FROM `sales_flat_shipment_track` as `t`
                    WHERE `main_table`.`entity_id` = `t`.`order_id`
                )'),
                'title' => new Zend_Db_Expr('(
                    SELECT GROUP_CONCAT(`t`.`title` SEPARATOR ",")
                    FROM `sales_flat_shipment_track` as `t`
                    WHERE `main_table`.`entity_id` = `t`.`order_id`
                )'),
            )
        );

    $this->setCollection($this);

    return parent::_prepareCollection();
}

Para o seu ponto sobre os títulos de operadora duplicados, isso é esperado em um caso como este. A única maneira de contornar isso é adicionar um DISTINCT word na subconsulta para o título, assim:
SELECT GROUP_CONCAT(DISTINCT `t`.`title` SEPARATOR ",")

Mas não tenho certeza do que você planeja fazer com esses dados na grade. Espero que ajude.