Inserindo vários valores em várias colunas de uma matriz de dados usando uma instrução PDO preparada para MySQL

Sim, bindParam vincula um parâmetro a um nome de variável (referência), não um valor, como diz o manual .

No entanto, há uma sintaxe mais simples para sua situação. PDOStatement::execute pode receber uma matriz de valores.

public function insert($table, $cols, $values){

    $placeholder = array();
    for ($i = 0; i < count($values); $i++)
      $placeholder[] = '?';

    $sql = 'INSERT INTO '. $table . ' (`' . implode("`, `", $cols) . '`) ';
    $sql.= 'VALUES (' . implode(", ", $placeholder) . ')';

    $stmt = $this->dbh->prepare($sql);
    $stmt->execute($values);

}