Postando como resposta, pois não consigo postar a imagem nos comentários. http://www.csvjson.com/sql2json parece funcionar bem com várias linhas. Talvez tenha algum limite?
Quantos registros você está tentando inserir?
ATUALIZAÇÃO Rockstar Martin Drapeau, o cara por trás do csvjson.com, acabou de implementar minha solicitação de recurso , então agora a sintaxe do mysqldump INSERT funcionará em seu site. Experimente aqui .