Você pode tentar iniciar a transação antes da iteração e depois confirmá-la em uma única transação. Então, basicamente você está criando um lote que seria mesclado/persistente no commit.
Além disso, você pode limitar o número de objetos em um lote a serem processados por vez e pode liberar explicitamente as alterações no banco de dados.
Aqui, você está iniciando uma transação e confirmando-a em cada iteração e também criando/fechando o gerenciador de entidade a cada vez, afetará o desempenho de vários dados.
Será algo como o código abaixo.
em = factory.createEntityManager();
em.getTransaction().begin();
int i = 0;
for (Object ob : list) {
Long start = Calendar.getInstance().getTimeInMillis();
em.merge(ob);
Long end = Calendar.getInstance().getTimeInMillis();
Long diff = end - start;
LOGGER.info("Time: " + diff);
/*BATCH_SIZE is the number of entities
that will be persisted/merged at once */
if(i%BATCH_SIZE == 0){
em.flush();
em.clear();
}
i++;
}
em.getTransaction().commit();
em.close();
Aqui, você também pode reverter toda a transação se algum objeto falhar em persistir/mesclar.
