você está tentando carregar arquivos csv em uma tabela MySQL? Você pode fazer isso facilmente com o LOAD DATA LOCAL INFILE comando.

Exemplo:

LOAD DATA LOCAL INFILE '/data.csv' INTO TABLE my_table FIELDS TERMINATED BY ','

Você deve ser capaz de inserir esse comando de qualquer interface para o MySQL. Estou assumindo que o workbench tem uma maneira de executar consultas sql.