Será mais eficiente fazer pequenas alterações na consulta - tornando mais fácil gerar SQL (equivalente) dinamicamente.
Ele usa o operador "entre" para evitar listas de comprimento variável para as condições 'in (...)'.
Observe o comentário sobre 1=1, ele é mantido conforme a pergunta, mas precisa ser revisto, pois sempre fará a condição passar.
min_date='2020-06-06'
max_date='2020-06-08'
max_seq_min_date=1
max_seq_max_date=3
echo "
WHERE 1 = 1 or case
when batch_date = '$min_date' then seq_num between 1 and $max_seq_min_date
when batch_date = '$max_date' then seq_num between 1 and $max_seq_max_date
when batch_date between '$min_date' and '$max_date' then seq_num between 1 and 4
else false
end
"
Eu NÃO tenho mysql, mas o acima funciona para o Postgresql.