Você tem algumas maneiras de fazer isso, mas tentando não criar tabelas temporárias, você pode fazer algo assim:
select
s.id,
avg(case when sb.id = '01' then s.score end) as math,
avg(case when sb.id = '02' then s.score end) as bio
from student s
join subject sb on (sb.id = s.subject_id)
group by s.id
Basta preencher as linhas de soma/caso para os outros assuntos conforme necessário!
Espero que ajude.