Você deve descomentar esta parte:
#location ~ \.php$ {
# root html;
# fastcgi_pass unix:/var/run/php5-fpm.sock;
# fastcgi_index index.php;
# fastcgi_param SCRIPT_FILENAME /scripts$fastcgi_script_name;
# include fastcgi_params;
#}
Edite o arquivo
/var/run/php5-fpm.sock e altere listen = 127.0.0.1:9000 para listen = /var/run/php5-fpm.sock . E para permitir que o servidor processe apenas o caminho exato do arquivo, edite
/etc/php5/fpm/php.ini e certifique-se de que cgi.fix_pathinfo=0 . 
