Hehe, isso é meio que um hack, mas funciona (usando o bash):
mysqldump -u USER -p DATABASE $(mysql -u USER -p -D DATABASE -Bse "show tables like 'PREFIX%'") > /tmp/DATABASE.out
Altere as palavras em maiúsculas conforme necessário.
mysqldump -u USER -p DATABASE $(mysql -u USER -p -D DATABASE -Bse "show tables like 'PREFIX%'") > /tmp/DATABASE.out
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