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MySQL GROUP BY várias colunas de diferentes tabelas


Sua pergunta
SELECT sum(d.data) as total
FROM data d, ta, tb
WHERE
(d.type LIKE "type_a" AND d.type_id = ta.id) 
OR 
(d.type LIKE "type_b" AND d.type_id = tb.id) 
GROUP BY a.customer_id, b.customer_id;

Digamos que haja apenas um registro em d, e seja type_a. Existem dois registros em ta e tb cada. O registro em d corresponde a um dos registros em ta em d.type_id=ta.id . Portanto, essa combinação de (d x ta) permite que QUALQUER registro tb permaneça no resultado final. Você obtém um produto cartesiano não intencional.
SELECT x.customer_id, SUM(data) total
FROM
(
    SELECT ta.customer_id, d.data
    FROM data d JOIN ta
       ON (d.type LIKE "type_a" AND d.type_id = ta.id) 
    UNION ALL
    SELECT tb.customer_id, d.data
    FROM data d JOIN tb
       ON (d.type LIKE "type_b" AND d.type_id = tb.id) 
) X
GROUP BY x.customer_id;