Você pode usar
LOAD DATA INFILE
para ler o conteúdo de um arquivo e armazená-lo em uma tabela no banco de dados em formato estruturado. Isso pode ser consideravelmente mais rápido do que ler e analisar o arquivo no cliente e usar várias instruções INSERT.
Exemplo:
LOAD DATA INFILE 'data.txt' INTO TABLE db2.my_table;