Finalmente consegui fazer isso funcionar!!!
Eu tive que usar unpack para extrair os dados binários do MySQL
$point_value = $data_from_db["point_field"];
$coordinates = unpack('x/x/x/x/corder/Ltype/dlat/dlon', $point_value);
echo $coordinates['lat'];
echo $coordinates['lon'];
Aqui é um tutorial que me ajudou com esta questão