A solução é aninhar ORDER BY e LIMIT em uma cláusula FROM como parte de uma junção. Isso permite que você encontre a linha exata a ser atualizada (ta.id) primeiro e, em seguida, confirme a atualização.
UPDATE tableA AS target
INNER JOIN (
SELECT ta.id
FROM tableA AS ta
INNER JOIN tableB AS tb ON tb.id = ta.user_id
WHERE tb.username = '$varName'
ORDER BY ta.datetime DESC
LIMIT 1) AS source ON source.id = target.id
SET col1 = '$var';
Gorjeta para Baron Schwartz, também conhecido como Xaprb, pelo excelente post sobre este tópico exato:http://www.xaprb.com/blog/2006/08/10/how-to-use- order-by-and-limit-on-multi-table-updates-in-mysql/