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Laravel Eloquent com dois “WHERE NOT IN” na subconsulta


Em vez de executar 3 consultas diferentes, você pode usar como mostrado abaixo,
DB::table('delivery_sap')
->whereNotIn('cust', function ($query) {
        $query->select('cust_name')->from('customer');
    })
->whereNotIn('cust_no', function ($query) {
        $query->select('cust_code')->from('customer');
    })
->select('cust', 'cust_no')
->distinct('cust')
->get();

Este código fornecerá exatamente a mesma consulta que é feita na pergunta, para verificar a consulta, use o seguinte código
DB::table('delivery_sap')
->whereNotIn('cust', function ($query) {
        $query->select('cust_name')->from('customer');
    })
->whereNotIn('cust_no', function ($query) {
        $query->select('cust_code')->from('customer');
    })
->select('cust', 'cust_no')
->distinct('cust')
->toSql();

A saída será,
select distinct `cust`, `cust_no` from `delivery_sap` 
where `cust` not in (select `cust_name` from `customer`) 
and `cust_no` not in (select `cust_code` from `customer`)