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PDO em loop e imprimindo fetchAll


Deveria ser 
while ($row = $query->fetch(PDO::FETCH_ASSOC)) {
  $id = $row['id'];
  $n = $row['n'];
  $k = $row['k'];
}

Se você insistir em fetchAll , então 
$results = $query->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
foreach($results as $row) {
   $id = $row['id'];
   $n = $row['n'];
   $k = $row['k'];
}

PDO::FETCH_ASSOC busca apenas nomes de colunas e omite o índice numérico.