• Em Administração do servidor na janela inicial, selecione a instância do servidor para a qual você deseja restaurar o banco de dados (Criar Nova instância do servidor se estiver fazendo isso pela primeira vez).
• Clique em Gerenciar importação/exportação
• Clique em Importar/Restaurar dados no lado esquerdo da tela.
• Selecione Importar de arquivo independente botão de opção (lado direito da tela)
• Selecione o caminho de .sql
• Clique em Iniciar importação botão no canto inferior direito da janela.

Espero que ajude.

---Resposta editada---

Sobre a seleção do esquema. MySQL Workbench (5.2.47 CE Rev1039) ainda não suporta a exportação para o esquema definido pelo usuário. Ele criará apenas o esquema para o qual você exportou o .sql... Na versão 5.2.47 vemos "Novo" esquema de destino. Mas não funciona. Eu uso o MySQL Administrator (a antiga beleza do MySQL Admin pré-Oracle) para meu trabalho de backup/restauração. Você ainda pode baixá-lo de fontes confiáveis ​​do Google (procure MySQL Administrator 1.2.17).