Fazendo backup de banco de dados no MySQL usando C #

Você pode usar o MySqlBackup.NET como alternativa ao MySqlDump
Documentação:
http://www.codeproject.com/Articles/256466/MySqlBackup-NET-MySQL-Backup-Solution-for-Csharp-V
https://github.com/MySqlBackupNET/MySqlBackup.Net

Códigos de amostra:

Faça backup de um banco de dados MySQL

using MySql.Data.MySqlClient;

então o código

private void Backup()
{
    string constring = "server=localhost;user=root;pwd=qwerty;database=test;";
    string file = "C:\\backup.sql";
    using (MySqlConnection conn = new MySqlConnection(constring))
    {
        using (MySqlCommand cmd = new MySqlCommand())
        {
            using (MySqlBackup mb = new MySqlBackup(cmd))
            {
                cmd.Connection = conn;
                conn.Open();
                mb.ExportToFile(file);
                conn.Close();
            }
        }
    }
}

Restaurar um banco de dados MySQL

private void Restore()
{
    string constring = "server=localhost;user=root;pwd=qwerty;database=test;";
    string file = "C:\\backup.sql";
    using (MySqlConnection conn = new MySqlConnection(constring))
    {
        using (MySqlCommand cmd = new MySqlCommand())
        {
            using (MySqlBackup mb = new MySqlBackup(cmd))
            {
                cmd.Connection = conn;
                conn.Open();
                mb.ImportFromFile(file);
                conn.Close();
            }
        }
    }
}

Atualização:
Sou um dos autores desta biblioteca.