O key_len especifica o número de bytes que o MySQL usa da chave.
Os índices são sempre usados left_to_right. ou seja, apenas a parte mais à esquerda é usada.
O comprimento dos seus campos é o seguinte:
1 byte `Type` char(1) NOT NULL,
1 byte tn char(1) NOT NULL DEFAULT 'l',
1 byte act tinyint(1) unsigned NOT NULL DEFAULT '0',
3 bytes flA mediumint(6) unsigned NOT NULL DEFAULT '0',
1+1+1+3 = 6 bytes KEY `Index` (`Type`, `tn`, `act`, `flA`)
key usage always starts here ---^^^^^
Se key_len =3 então está usando
type+tn+act
.Observe que Key_len =4 é impossível nesta configuração.